Hermann Schumacher war der Sohn des Juristen, Historikers und Syndicus der Handelskammer Bremen Hermann Albert Schumacher (1839–1890) und der Bruder des Architekten und Stadtplaners Fritz Schumacher. Sein Urgroßvater Isak Hermann Albrecht Schumacher war der letzte Bremer Bürgermeister auf Lebenszeit. Hermann Schumacher wuchs in Nord- und Südamerika auf, da sein Vater in Kolumbien, New York und in Peru tätig war. 1886 kehrte die Familie nach Bremen zurück. Nach Besuch der Abschlussklassen des Alten Gymnasiums studierte er in München, Freiburg, Wien und Berlin Rechts- und Staatswissenschaften. Schumacher wurde 1891 in Jena mit summa cum laude promoviert und im selben Jahr begann das Referendariat. 1893 unternahm er seine erste große Studienreise in die Vereinigten Staaten, deren Resultate die ausgezeichnete Arbeit "Der Getreidehandel in den Vereinigten Staaten Amerikas" (1895) war. In den Jahren 1897–1898 bereiste er als Mitglied der Kommission gewerblicher Sachverständiger Ostasien und erhielt nach seiner Rückkehr eine außerordentliche Professur für Nationalökonomie in Kiel (1899–1901).
1901 wurde er als erster Studiendirektor der Städtischen Handelshochschule Köln berufen, sehr bald, 1904, wurde er aber auf eine ordentliche Professur für Staatswissenschaften an der Rheinischen Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn berufen, den er bis zum Jahre 1917 innehatte. 1906/1907 nahm er die Kaiser-Wilhelm-Professur an der Columbia University in New York wahr. Seine Karriere endete an der Hauptstadtuniversität, der Friedrich-Wilhelms-Universität bis 1935. Dort wurde er mit 67 Jahren emeritiert. Einer seiner Schüler in Bonn und Berlin war Walter Eucken.